MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Methanococcoides burtonii DSM 6242

Total Repeats: 51802

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_007955	TAT	2	6	6	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_007955	CAT	2	6	14	19	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_007955	CTT	2	6	101	106	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_007955	TCT	2	6	146	151	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_007955	GAT	2	6	155	160	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_007955	GGAC	2	8	164	171	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_007955	TTA	2	6	179	184	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_007955	GTTA	2	8	203	210	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
9	NC_007955	TTGTC	2	10	309	318	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
10	NC_007955	CAT	2	6	322	327	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_007955	AAT	2	6	352	357	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_007955	AGG	2	6	364	369	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_007955	CGA	2	6	543	548	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772083
14	NC_007955	ATC	2	6	598	603	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772083
15	NC_007955	GCA	2	6	625	630	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772083
16	NC_007955	TTG	2	6	773	778	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772083
17	NC_007955	TCA	2	6	806	811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772083
18	NC_007955	TGATG	2	10	858	867	20 %	40 %	40 %	0 %	91772083
19	NC_007955	TGG	2	6	935	940	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772083
20	NC_007955	TCG	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772083
21	NC_007955	GAA	2	6	1044	1049	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772083
22	NC_007955	AGGT	2	8	1079	1086	25 %	25 %	50 %	0 %	91772083
23	NC_007955	CAGG	2	8	1132	1139	25 %	0 %	50 %	25 %	91772083
24	NC_007955	ACA	2	6	1169	1174	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772083
25	NC_007955	TGA	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772083
26	NC_007955	TGG	2	6	1221	1226	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772083
27	NC_007955	TCCA	2	8	1287	1294	25 %	25 %	0 %	50 %	91772083
28	NC_007955	CAA	2	6	1319	1324	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772083
29	NC_007955	ACA	2	6	1401	1406	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772084
30	NC_007955	ATTGC	2	10	1446	1455	20 %	40 %	20 %	20 %	91772084
31	NC_007955	GACCT	2	10	1480	1489	20 %	20 %	20 %	40 %	91772084
32	NC_007955	AAG	2	6	1494	1499	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772084
33	NC_007955	CCA	2	6	1677	1682	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91772084
34	NC_007955	AGACCG	2	12	1684	1695	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772084
35	NC_007955	AGA	2	6	1705	1710	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772084
36	NC_007955	CAA	2	6	1712	1717	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772084
37	NC_007955	GCA	2	6	1752	1757	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772084
38	NC_007955	GAT	2	6	1824	1829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772084
39	NC_007955	TCA	2	6	1861	1866	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772084
40	NC_007955	TTC	2	6	1870	1875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772084
41	NC_007955	ATG	2	6	1891	1896	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772084
42	NC_007955	AGGTAA	2	12	1934	1945	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	91772084
43	NC_007955	GAA	2	6	1998	2003	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772084
44	NC_007955	GCA	2	6	2019	2024	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772084
45	NC_007955	AAC	2	6	2025	2030	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772084
46	NC_007955	CTT	2	6	2076	2081	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772084
47	NC_007955	GCAG	2	8	2097	2104	25 %	0 %	50 %	25 %	91772084
48	NC_007955	TCA	2	6	2178	2183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772085
49	NC_007955	ATG	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772085
50	NC_007955	GTT	2	6	2228	2233	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772085
51	NC_007955	AC	3	6	2235	2240	50 %	0 %	0 %	50 %	91772085
52	NC_007955	AGTC	2	8	2298	2305	25 %	25 %	25 %	25 %	91772085
53	NC_007955	TGC	2	6	2365	2370	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772085
54	NC_007955	CAA	2	6	2382	2387	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772085
55	NC_007955	GGATT	2	10	2388	2397	20 %	40 %	40 %	0 %	91772085
56	NC_007955	AAG	2	6	2608	2613	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772086
57	NC_007955	GTT	2	6	2623	2628	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772086
58	NC_007955	CCAAA	2	10	2747	2756	60 %	0 %	0 %	40 %	91772086
59	NC_007955	TGG	2	6	2760	2765	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772086
60	NC_007955	GC	3	6	2773	2778	0 %	0 %	50 %	50 %	91772086
61	NC_007955	AGT	2	6	2823	2828	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772086
62	NC_007955	GT	3	6	2846	2851	0 %	50 %	50 %	0 %	91772086
63	NC_007955	TTG	2	6	2891	2896	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772086
64	NC_007955	TGG	2	6	2898	2903	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772086
65	NC_007955	GAAA	2	8	2936	2943	75 %	0 %	25 %	0 %	91772086
66	NC_007955	CAG	2	6	3063	3068	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772086
67	NC_007955	CAC	2	6	3074	3079	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	91772086
68	NC_007955	GCA	2	6	3103	3108	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772086
69	NC_007955	A	7	7	3151	3157	100 %	0 %	0 %	0 %	91772087
70	NC_007955	GGAAA	2	10	3335	3344	60 %	0 %	40 %	0 %	91772087
71	NC_007955	ACGC	2	8	3349	3356	25 %	0 %	25 %	50 %	91772087
72	NC_007955	TAC	2	6	3587	3592	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772088
73	NC_007955	GCA	2	6	3699	3704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772088
74	NC_007955	TGT	2	6	3722	3727	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772088
75	NC_007955	GCAG	2	8	3737	3744	25 %	0 %	50 %	25 %	91772088
76	NC_007955	GCA	2	6	3795	3800	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772088
77	NC_007955	GAT	2	6	4001	4006	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772088
78	NC_007955	GTTC	2	8	4042	4049	0 %	50 %	25 %	25 %	91772089
79	NC_007955	GGAT	2	8	4051	4058	25 %	25 %	50 %	0 %	91772089
80	NC_007955	CAG	2	6	4099	4104	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772089
81	NC_007955	TGG	2	6	4114	4119	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772089
82	NC_007955	GAT	2	6	4303	4308	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772089
83	NC_007955	TCC	2	6	4325	4330	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91772089
84	NC_007955	GTGG	2	8	4338	4345	0 %	25 %	75 %	0 %	91772089
85	NC_007955	ACA	2	6	4365	4370	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772089
86	NC_007955	TCAAGG	2	12	4439	4450	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	91772089
87	NC_007955	GAT	2	6	4499	4504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772089
88	NC_007955	GAT	2	6	4511	4516	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772089
89	NC_007955	TTC	2	6	4587	4592	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772089
90	NC_007955	GAA	2	6	4609	4614	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772089
91	NC_007955	GAA	2	6	4619	4624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772089
92	NC_007955	GAA	2	6	4652	4657	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772089
93	NC_007955	GAA	2	6	4781	4786	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772089
94	NC_007955	GCA	2	6	4790	4795	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772089
95	NC_007955	GAA	2	6	4838	4843	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772089
96	NC_007955	GAG	2	6	4847	4852	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91772089
97	NC_007955	CGC	2	6	4853	4858	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91772089
98	NC_007955	TGG	2	6	4888	4893	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772089
99	NC_007955	ACT	2	6	4899	4904	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772089
100	NC_007955	TTC	2	6	4949	4954	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772090
101	NC_007955	CAG	2	6	5048	5053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772090
102	NC_007955	CAA	2	6	5214	5219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772091
103	NC_007955	AGACG	2	10	5254	5263	40 %	0 %	40 %	20 %	91772091
104	NC_007955	TTA	2	6	5274	5279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91772091
105	NC_007955	A	6	6	5301	5306	100 %	0 %	0 %	0 %	91772091
106	NC_007955	TCA	2	6	5348	5353	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772091
107	NC_007955	CGATCA	2	12	5359	5370	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	91772091
108	NC_007955	ATT	2	6	5392	5397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91772091
109	NC_007955	TAA	2	6	5450	5455	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91772091
110	NC_007955	ATTGG	2	10	5470	5479	20 %	40 %	40 %	0 %	91772092
111	NC_007955	CAA	2	6	5492	5497	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772092
112	NC_007955	TGA	2	6	5505	5510	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772092
113	NC_007955	TGT	2	6	5568	5573	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772092
114	NC_007955	ATAA	2	8	5626	5633	75 %	25 %	0 %	0 %	91772092
115	NC_007955	GCC	2	6	5729	5734	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	91772092
116	NC_007955	ATA	2	6	5848	5853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91772093
117	NC_007955	AAG	2	6	5886	5891	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772093
118	NC_007955	TG	3	6	5938	5943	0 %	50 %	50 %	0 %	91772093
119	NC_007955	AAG	2	6	5955	5960	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772093
120	NC_007955	AGA	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772093
121	NC_007955	CGT	2	6	6024	6029	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772093
122	NC_007955	AGC	2	6	6131	6136	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772093
123	NC_007955	TG	3	6	6176	6181	0 %	50 %	50 %	0 %	91772093
124	NC_007955	GGC	2	6	6267	6272	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	91772094
125	NC_007955	GTG	2	6	6350	6355	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772094
126	NC_007955	AAAGG	2	10	6370	6379	60 %	0 %	40 %	0 %	91772094
127	NC_007955	TTG	2	6	6410	6415	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772094
128	NC_007955	TGGA	2	8	6440	6447	25 %	25 %	50 %	0 %	91772094
129	NC_007955	TGA	2	6	6482	6487	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772094
130	NC_007955	ATGA	2	8	6502	6509	50 %	25 %	25 %	0 %	91772094
131	NC_007955	AGGT	2	8	6537	6544	25 %	25 %	50 %	0 %	91772094
132	NC_007955	TCA	2	6	6559	6564	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772095
133	NC_007955	CAA	2	6	6610	6615	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772095
134	NC_007955	AG	3	6	6723	6728	50 %	0 %	50 %	0 %	91772095
135	NC_007955	CT	3	6	6731	6736	0 %	50 %	0 %	50 %	91772095
136	NC_007955	TTG	2	6	6750	6755	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772095
137	NC_007955	ATT	2	6	6803	6808	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91772095
138	NC_007955	AAC	2	6	6821	6826	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772095
139	NC_007955	AAG	2	6	6933	6938	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772095
140	NC_007955	CAA	2	6	6985	6990	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772095
141	NC_007955	AAT	2	6	7009	7014	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91772095
142	NC_007955	GTC	2	6	7037	7042	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772095
143	NC_007955	TGG	2	6	7084	7089	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772095
144	NC_007955	AAC	2	6	7148	7153	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772095
145	NC_007955	GGT	2	6	7241	7246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772095
146	NC_007955	GTC	2	6	7293	7298	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	91772096
147	NC_007955	TTG	2	6	7330	7335	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772096
148	NC_007955	GACA	2	8	7366	7373	50 %	0 %	25 %	25 %	91772096
149	NC_007955	AGC	2	6	7463	7468	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772096
150	NC_007955	TCTT	2	8	7725	7732	0 %	75 %	0 %	25 %	91772096
151	NC_007955	AAT	2	6	7759	7764	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91772096
152	NC_007955	GAA	2	6	7777	7782	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772097
153	NC_007955	AT	3	6	7850	7855	50 %	50 %	0 %	0 %	91772097
154	NC_007955	TAT	2	6	7931	7936	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91772098
155	NC_007955	TAT	2	6	7962	7967	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91772098
156	NC_007955	ATGA	2	8	8047	8054	50 %	25 %	25 %	0 %	91772098
157	NC_007955	AT	3	6	8061	8066	50 %	50 %	0 %	0 %	91772098
158	NC_007955	GA	3	6	8185	8190	50 %	0 %	50 %	0 %	91772098
159	NC_007955	TTCC	2	8	8203	8210	0 %	50 %	0 %	50 %	91772098
160	NC_007955	GGT	2	6	8290	8295	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772098
161	NC_007955	TTA	2	6	8299	8304	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91772098
162	NC_007955	GAT	2	6	8332	8337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_007955	AAT	2	6	8358	8363	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91772099
164	NC_007955	GAA	2	6	8397	8402	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772099
165	NC_007955	A	6	6	8515	8520	100 %	0 %	0 %	0 %	91772099
166	NC_007955	ATG	2	6	8563	8568	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772099
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170	NC_007955	CAA	2	6	8757	8762	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772099
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177	NC_007955	TGA	2	6	8955	8960	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772100
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182	NC_007955	CAA	2	6	9326	9331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772100
183	NC_007955	GAGT	2	8	9333	9340	25 %	25 %	50 %	0 %	91772100
184	NC_007955	A	6	6	9363	9368	100 %	0 %	0 %	0 %	91772101
185	NC_007955	GAGCAA	2	12	9528	9539	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	91772101
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187	NC_007955	GAAG	2	8	9651	9658	50 %	0 %	50 %	0 %	91772101
188	NC_007955	AC	3	6	9761	9766	50 %	0 %	0 %	50 %	91772101
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190	NC_007955	GGA	2	6	9838	9843	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
191	NC_007955	CGA	2	6	9886	9891	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91772102
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193	NC_007955	GTT	2	6	9952	9957	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772102
194	NC_007955	TTG	2	6	9992	9997	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772102
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236	NC_007955	TA	3	6	12891	12896	50 %	50 %	0 %	0 %	91772106
237	NC_007955	TTC	2	6	12905	12910	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772106
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247	NC_007955	TGG	2	6	13389	13394	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772106
248	NC_007955	TTG	2	6	13411	13416	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91772106
249	NC_007955	AGTA	2	8	13422	13429	50 %	25 %	25 %	0 %	91772106
250	NC_007955	GAT	2	6	13467	13472	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772106
251	NC_007955	TTC	2	6	13498	13503	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772106
252	NC_007955	AAT	2	6	13511	13516	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91772106
253	NC_007955	AAT	2	6	13519	13524	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
254	NC_007955	AT	3	6	13529	13534	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
255	NC_007955	TGA	2	6	13535	13540	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772107
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258	NC_007955	TGA	2	6	13716	13721	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772107
259	NC_007955	TCT	2	6	13779	13784	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772107
260	NC_007955	CTC	2	6	13805	13810	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91772107
261	NC_007955	TGA	2	6	13884	13889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91772107
262	NC_007955	GT	3	6	13921	13926	0 %	50 %	50 %	0 %	91772107
263	NC_007955	GTG	2	6	13931	13936	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772107
264	NC_007955	CCT	2	6	13960	13965	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91772107
265	NC_007955	TAT	2	6	14086	14091	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91772107
266	NC_007955	TCT	2	6	14103	14108	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91772107
267	NC_007955	AAG	2	6	14222	14227	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91772108
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403	NC_007955	ACA	2	6	20284	20289	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91772114
404	NC_007955	GTGAT	2	10	20330	20339	20 %	40 %	40 %	0 %	91772114
405	NC_007955	ATC	2	6	20377	20382	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91772114
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407	NC_007955	TACC	2	8	20436	20443	25 %	25 %	0 %	50 %	91772114
408	NC_007955	AT	4	8	20519	20526	50 %	50 %	0 %	0 %	91772114
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434	NC_007955	TGG	2	6	22338	22343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772114
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437	NC_007955	TGG	2	6	22505	22510	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91772114
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